Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
E2f3O35261 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
E2f3O35261 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
E2f3O35261 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
E2f3O35261 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
E2f3O35261 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
E2f3O35261 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
E2f3O35261 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
E2f3O35261 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
E2f3O35261 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
E2f3O35261 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
E2f3O35261 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
E2f3O35261 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
E2f3O35261 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
E2f3O35261 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
E2f3O35261 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
E2f3O35261 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
E2f3O35261 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
E2f3O35261 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
E2f3O35261 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms