Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmem200cJ3QK46 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms