Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms