Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Prrt4B2RU40 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Prrt4B2RU40 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms