Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Zfp978-202ENSMUST00000154154 1250 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm11817-201ENSMUST00000155578 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 AC123738.1-201ENSMUST00000224796 773 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 AC133189.3-201ENSMUST00000226269 878 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms