Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Atp8b5A3FIN4 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
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Atp8b5A3FIN4 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms