Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GabreA2AMW3 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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