Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

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Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Hdac5Q9Z2V6 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Hdac5Q9Z2V6 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Hdac5Q9Z2V6 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Hdac5Q9Z2V6 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Hdac5Q9Z2V6 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms