Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdac6Q9Z2V5 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms