Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms