Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Csnk1eQ9JMK2 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms