Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SrfQ9JM73 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms