Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Usp29Q9ES63 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms