Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms