Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pop7Q9DCH2 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms