Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 4933415A04Rik-201ENSMUST00000056256 2009 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Gtf3c6Q9D8P7 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Gtf3c6Q9D8P7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gtf3c6Q9D8P7 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Gtf3c6Q9D8P7 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Gtf3c6Q9D8P7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Gtf3c6Q9D8P7 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gtf3c6Q9D8P7 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gtf3c6Q9D8P7 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gtf3c6Q9D8P7 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gtf3c6Q9D8P7 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gtf3c6Q9D8P7 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gtf3c6Q9D8P7 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gtf3c6Q9D8P7 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gtf3c6Q9D8P7 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gtf3c6Q9D8P7 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gtf3c6Q9D8P7 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gtf3c6Q9D8P7 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gtf3c6Q9D8P7 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gtf3c6Q9D8P7 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gtf3c6Q9D8P7 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gtf3c6Q9D8P7 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gtf3c6Q9D8P7 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gtf3c6Q9D8P7 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gtf3c6Q9D8P7 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gtf3c6Q9D8P7 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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