Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Capns2Q9D7J7 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Capns2Q9D7J7 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Capns2Q9D7J7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Capns2Q9D7J7 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Capns2Q9D7J7 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Capns2Q9D7J7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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