Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms