Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Lrrc17Q9CXD9 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc17Q9CXD9 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc17Q9CXD9 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc17Q9CXD9 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc17Q9CXD9 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc17Q9CXD9 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc17Q9CXD9 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc17Q9CXD9 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Lrrc17Q9CXD9 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms