Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr55Q9CX97 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms