Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Khdc3Q9CWU5 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc3Q9CWU5 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms