Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim26Q99PN3 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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