Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms