Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tdrd1Q99MV1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tdrd1Q99MV1 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tdrd1Q99MV1 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tdrd1Q99MV1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tdrd1Q99MV1 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tdrd1Q99MV1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tdrd1Q99MV1 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tdrd1Q99MV1 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tdrd1Q99MV1 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tdrd1Q99MV1 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
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Tdrd1Q99MV1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tdrd1Q99MV1 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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