Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ciao1Q99KN2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ciao1Q99KN2 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ciao1Q99KN2 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ciao1Q99KN2 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ciao1Q99KN2 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ciao1Q99KN2 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ciao1Q99KN2 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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