Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Ddb2Q99J79 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Ddb2Q99J79 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Ddb2Q99J79 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Ddb2Q99J79 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Ddb2Q99J79 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Ddb2Q99J79 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Ddb2Q99J79 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ddb2Q99J79 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ddb2Q99J79 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ddb2Q99J79 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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