Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Smim11aQ99J19 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Smim11aQ99J19 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Smim11aQ99J19 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim11aQ99J19 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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