Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Slc8b1Q925Q3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms