Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttc8Q8VD72 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Ttc8Q8VD72 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ttc8Q8VD72 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ttc8Q8VD72 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ttc8Q8VD72 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc8Q8VD72 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms