Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OptnQ8K3K8 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
OptnQ8K3K8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms