Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Fbxo18Q8K2I9 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Fbxo18Q8K2I9 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Fbxo18Q8K2I9 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms