Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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LgsnQ8CIX8 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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LgsnQ8CIX8 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LgsnQ8CIX8 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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LgsnQ8CIX8 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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LgsnQ8CIX8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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LgsnQ8CIX8 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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LgsnQ8CIX8 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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LgsnQ8CIX8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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LgsnQ8CIX8 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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LgsnQ8CIX8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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LgsnQ8CIX8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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LgsnQ8CIX8 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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LgsnQ8CIX8 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms