Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Hpf1Q8CFE2 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hpf1Q8CFE2 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms