Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nup88Q8CEC0 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nup88Q8CEC0 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms