Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm44805-201ENSMUST00000127648 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Tead1-211ENSMUST00000170352 1218 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm20629-201ENSMUST00000176157 513 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm2021-201ENSMUST00000190623 464 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm45808-201ENSMUST00000210701 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 n-R5s154-201ENSMUST00000122513 108 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm15419-201ENSMUST00000148654 743 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm23916-201ENSMUST00000158484 399 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 AC122357.1-202ENSMUST00000221436 633 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nhsl1Q8CAF4 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm12047-201ENSMUST00000117561 944 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm23899-201ENSMUST00000158112 90 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Rpl17-ps11-201ENSMUST00000161946 729 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Zkscan7-205ENSMUST00000216462 990 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Olfr160-202ENSMUST00000211952 3492 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Mrps33-202ENSMUST00000114797 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm25804-201ENSMUST00000122785 188 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm29651-201ENSMUST00000189088 697 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 1700069L16Rik-201ENSMUST00000047891 537 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nhsl1Q8CAF4 Taar1-201ENSMUST00000051532 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms