Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cwc22Q8C5N3 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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