Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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