Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdac7Q8C2B3 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdac7Q8C2B3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms