Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc21aQ8C0S4 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms