Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

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Length 1,235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40Q8BWR4 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Usp40Q8BWR4 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Usp40Q8BWR4 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Usp40Q8BWR4 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Usp40Q8BWR4 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp40Q8BWR4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp40Q8BWR4 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp40Q8BWR4 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp40Q8BWR4 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp40Q8BWR4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp40Q8BWR4 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp40Q8BWR4 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp40Q8BWR4 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp40Q8BWR4 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp40Q8BWR4 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp40Q8BWR4 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp40Q8BWR4 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp40Q8BWR4 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp40Q8BWR4 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp40Q8BWR4 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp40Q8BWR4 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp40Q8BWR4 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp40Q8BWR4 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp40Q8BWR4 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp40Q8BWR4 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp40Q8BWR4 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp40Q8BWR4 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp40Q8BWR4 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp40Q8BWR4 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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