Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Zfp398Q8BV16 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Zfp398Q8BV16 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Zfp398Q8BV16 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Zfp398Q8BV16 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Zfp398Q8BV16 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Zfp398Q8BV16 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Zfp398Q8BV16 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Zfp398Q8BV16 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Zfp398Q8BV16 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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