Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Atg4dQ8BGV9 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Atg4dQ8BGV9 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Atg4dQ8BGV9 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Atg4dQ8BGV9 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Atg4dQ8BGV9 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atg4dQ8BGV9 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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