Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrfn4Q80XU8 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms