Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
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