Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo2Q7TSY8 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sgo2Q7TSY8 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms