Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nek5Q7TSC3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms