Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sall3Q62255 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sall3Q62255 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sall3Q62255 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sall3Q62255 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sall3Q62255 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sall3Q62255 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sall3Q62255 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sall3Q62255 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sall3Q62255 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sall3Q62255 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sall3Q62255 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sall3Q62255 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sall3Q62255 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sall3Q62255 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sall3Q62255 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sall3Q62255 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sall3Q62255 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sall3Q62255 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sall3Q62255 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sall3Q62255 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sall3Q62255 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sall3Q62255 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sall3Q62255 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sall3Q62255 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sall3Q62255 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sall3Q62255 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms