Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim38Q5SZ99 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms