Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psme4Q5SSW2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Psme4Q5SSW2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Psme4Q5SSW2 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Psme4Q5SSW2 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Psme4Q5SSW2 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psme4Q5SSW2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psme4Q5SSW2 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Psme4Q5SSW2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psme4Q5SSW2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psme4Q5SSW2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psme4Q5SSW2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psme4Q5SSW2 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psme4Q5SSW2 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Psme4Q5SSW2 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Psme4Q5SSW2 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Psme4Q5SSW2 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Psme4Q5SSW2 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psme4Q5SSW2 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Psme4Q5SSW2 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psme4Q5SSW2 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psme4Q5SSW2 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psme4Q5SSW2 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Psme4Q5SSW2 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Psme4Q5SSW2 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psme4Q5SSW2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Psme4Q5SSW2 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Psme4Q5SSW2 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Psme4Q5SSW2 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psme4Q5SSW2 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Psme4Q5SSW2 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psme4Q5SSW2 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms