Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trim58Q5NCC9 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trim58Q5NCC9 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trim58Q5NCC9 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trim58Q5NCC9 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trim58Q5NCC9 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trim58Q5NCC9 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trim58Q5NCC9 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Trim58Q5NCC9 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Trim58Q5NCC9 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Trim58Q5NCC9 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Trim58Q5NCC9 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim58Q5NCC9 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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